營運監理組掌理事項如下：
一、鐵道系統履勘作業及開始（停止）營運之審議。
二、鐵道系統行車運轉、行車人員技能體格之監督管理；列車駕駛執照之核發及管理。
三、鐵道系統旅客（貨物）運送之監督管理。
四、鐵道系統機車車輛檢修、土木建築、軌道、保安與防護、電信、電力及車站設備修建養護之監督管理。
五、鐵道系統營運、財務、安全管理與事故預防之監督管理及事故調查。
六、鐵道系統災害防救緊急應變小組運作策劃、協調、執行、訊息彙整及發布。
七、鐵道系統附屬事業之監督管理。
八、鐵路機構辦理鐵道文化資產管理及維護之督導。
九、高速鐵路動員準備計畫之擬訂及執行計畫之督導。
十、其他有關鐵道系統營運監理事項。