第五科掌理交通部、國家通訊傳播委員會、國家運輸安全調查委員會及其所屬機關之財物審計（財物報損報廢審計除外），辦理下列事項：
一、關於所管機關重要採購案件預算執行之監督事項。
二、關於所管機關採購之規劃、設計、招標、履約、驗收及其他相關作業稽察事項。
三、關於所管機關現金、票據、證券及其他一切財物之管理運用之調查事項。
四、關於所管機關財務效能之考核、財務責任之核定、財務上不法或不忠於職務之行為及其他專案之調查事項。
五、關於所管機關會計制度及內部審核有關採購規章之會商事項。
六、關於其他依法律應行辦理之財物審計事項。
七、關於立、監兩院諮詢所管機關財物審計案件（財物報損報廢審計案件除外）之擬復事項。
八、關於所管機關函請解釋有關財物審計法令（財物報損報廢審計法令除外）之擬辦事項。