本規則用詞，定義如下：
一、港埠：指設置於我國（境）內之國際港埠與國內港埠。
二、國際港埠：指主要供國際運輸工具及其人員入出之港埠或指定特殊港埠。
三、國內港埠：指國際港埠以外之港埠。
四、港埠經營管理機關（構）：指依法負責港埠經營管理之機關，或受港埠主管機關委託、委任或委辦負責港埠經營管理之機關或公、民營事業機構。
五、運輸工具：指船舶、航空器。
六、國內續航：指船舶自國（境）外入國（境）後至駛離我國期間，繼續至我國其他港埠航行或靠泊。
七、船舶衛生證明書：指船舶免予衛生管制證明書或船舶衛生管制證明書。
八、傳染病病人：指感染傳染病或疑似傳染病之病人，以及感染傳染病病原體之人。