第二局分設五科，各科掌理事項如左：
一 第一科、
(一) 行政院訂定年度施政方針所需增進營業預算、財務及經營效能建議
之研擬事項。
(二) 中央暨地方各級政府預算收支方針中有關公營事業預算收支原則之
研擬事項。
(三) 全國總資源供需估測所需有關資料之提供事項。
(四) 國營事業營業計畫總綱之擬訂、分行事項。
(五) 國營事業營業基金預算編審辦法及共同項目編列標準之擬訂、修正
、分行事項。
(六) 行政院年度計畫及預算審核會議有關事業預算各項提案之研擬事項
。
(七) 營業預算作業各項報告之撰擬及有關書面質詢與建議之擬答事項。
(八) 營業預算之審核、綜計、彙編與分析事項。
(九) 營業預算書表格式之製定、分行及有關資料之蒐集、保管事項。
(十) 政府與國營事業轉投資及受捐助社團、財團預算之彙辦事項。
(十一) 審定後營業預算之整編、提報、分行事項。
(十二) 營業預算執行狀況之分析、彙編、考核及分行事項。
(十三) 營業預算與財務會計之研究發展事項。
(十四) 營業預算資料之電子處理事項。
(十五) 公營事業會計科目之設定、修訂事項。
(十六) 營業預算法規之研究、解釋事項。
(十七) 交辦及其他有關本科主管事項。
二 第二科、
(一) 經濟部所屬事業預算之審核，決算之查核及預決算綜計說明資料之
編擬事項。
(二) 第一目所列各事業預算分期實施計畫及收支估計表之考核及其會計
報告與結算報告之審核事項。
(三) 第一目所列各事業預算編列標準補充規定之審核事項。
(四) 第一目所列各事業預算支出個別項目作業標準之審核事項。
(五) 第一目所列各事業特別公積之審核事項。
(六) 第一目所列各事業增資之審核事項。
(七) 第一目所列各事業人員出國計畫與預算之審核事項。
(八) 第一目所列各事業固定資產之建設、改良、擴充計畫評審及其資金
來源之審核事項。
(九) 第一目所列各事業長期債務之舉借與其償還辦法之審核事項。
(十) 第一目所列各事業資金轉投資及大宗動產、不動產處分變賣之審核
事項。
(十一) 第一目所列各事業產品成本計算基礎及勞務費率計算公式之審核
事項。
(十二) 第一目所列各事業收支及盈餘分配之審核事項。
(十三) 第一目所列各事業預算會計專案之研究及其統一處理辦法之訂定
、分行事項。
(十四) 第一目所列各事業會計制度及有關法規之審查、核辦事項。
(十五) 第一目所列各事業會計制度與內部審核辦理情形之調查、研究、
改進事項。
(十六) 交辦及其他有關本科主管事項。
三 第三科、
(一) 交通部及行政院衛生署所屬事業預算之審核，決算之查核及預決算
綜計說明資料之編擬事項。
(二) 第一目所列各事業預算分期實施計畫及收支估計表之考核及其會計
報告與結算報告之審核事項。
(三) 第一目所列各事業預算編列標準補充規定之審核事項。
(四) 第一目所列各事業特別公積之審核事項。
(五) 第一目所列各事業增資之審核事項。
(六) 第一目所列各事業人員出國計畫與預算之審核事項。
(七) 第一目所列各事業固定資產之建設、改良、擴充計畫評審及其資金
來源之審核事項。
(八) 第一目所列各事業長期債務之舉借與其償還辦法