資訊室分設三科，各科掌理事項如下：
一、第一科
(一) 關於行政院所屬各機關人事行政資訊系統之統籌規劃事項。
(二) 關於行政院所屬各機關人事行政資訊系統之推動計劃事項。
(三) 關於行政院所屬各機關人事資料之蒐集、彙整及運用事項。
(四) 關於本局業務資訊化之規劃、設計及管理事項。
二、第二科
(一) 關於本局電腦系統硬、軟體與相關設備之規劃及管理事項。
(二) 關於本局辦公室自動化之推動事項。
(三) 關於本局資訊之應用、諮詢服務及訓練事項。
(四) 關於本室業務之綜合規劃、協調、追蹤及管制事項。
三、第三科
(一) 關於行政院所屬各機關人事行政資訊系統推廣輔導事項。
(二) 關於本局地方人事行政處主機資料庫管理與維護事項。
(三) 關於人事資訊作業流程及人事資料報表之標準化規劃事項。