徵收科掌理稅款徵收、劃解退稅、清理欠稅及欠稅執行等事宜。分設二股
，各股之職掌如下：
一、徵收劃退股：
（一）徵收業務之規劃。
（二）分局、稽徵所有關徵收業務之督導及考核。
（三）大批退稅作業計畫之擬訂。
（四）有關公庫代收稅款報表編製之輔導。
（五）各項稅款劃解業務規劃及督導。
（六）分項稅捐收入狀況之統計。
（七）分局、稽徵所有關退稅業務之督導及考核。
（八）其他行政事項及有關徵收、劃解、退稅業務之處理。
二、欠稅清理及執行股：
（一）欠稅清理業務之規劃。
（二）欠稅清理作業計畫之擬訂。
（三）欠稅、罰鍰摯發債權憑證案件之清理計劃擬訂。
（四）限制及解除出境案件之管制及處理。
（五）各項欠稅清理報表之審核、統計、彙編。
（六）分局、稽徵所有關欠稅保全、移送執行、債權憑證保管、債權登記
及參與分配等清理業務之督導及考核。
（七）配合行政執行機關辦理滯納及罰鍰案件執行事件之規劃督導及考核
事宜。
（八）鉅額欠稅案件專案追查業務之規劃督導及考核事宜。
（九）清算、破產及重整案件申報租稅債權及辦理相關作業程序之審核。
（十）其他有關欠稅清理業務及執行事項之處理。