秘書室掌理文書、事務、出納、檔案等事宜。分設四股，各股之職掌如下
：
一、文書股：
(一) 公文書之總收文及分文。
(二) 文稿之收繕、校對、編號及總發文。
(三) 文稿之銷號及歸檔。
(四) 各單位公文收發人員作業之訓練。
(五) 機密公文書之處理 (含檢舉案件) 。
(六) 印信典守。
二、事務股：
(一) 土地及建築物之產權登記、維修及管理。
(二) 財產之接管、維護、報廢及變賣。
(三) 員工宿舍之分配、管理及檢修。
(四) 各種辦公用品、器材之購置、核發及保管。
(五) 駕駛、技工、工友之僱免及管理。
(六) 各種車輛之調派管理及肇事管理。
(七) 油料、水電、電話、環境衛生之管理。
(八) 各項事務費用之支付、報銷。
(九) 各會議場所之管理。
(十) 防護團之組訓事宜。
(十一) 營建及修繕工程。
三、出納股：
(一) 零用金核銷及保管。
(二) 各項出納帳簿、表報之編製及登帳。
(三) 黃金、外幣、有價證券、公債、存單、原封等擔保品寄存台灣銀行
後憑證之保管。
(四) 各項公款、押標金之收受及存庫。
(五) 各項經費之支付。
(六) 員工薪資、罰鍰獎金、年終獎金、考績獎金、不休假加班費、休假
補助費、差旅費、加班費、值日 (夜) 費等之發放。
(七) 保險費、互助金、住宅貸款、急難貨款、優惠存款、法院扣款、小
額貸款、所得稅、房租等之扣繳。
(八) 扣免繳憑單之填發申報。
(九) 其他款項之代收及代付。
四、檔案股：
(一) 歸檔文稿之點收及銷號。
(二) 歸檔文稿之分案、立卷及點藏。
(三) 歸檔之整理、歸卷、裝訂及典藏。
(四) 逾期檔案之銷燬。
(五) 檔案調、閱卷之管理。
(六) 卷櫃之調整及整理。
(七) 檔案應用。
(八) 編訂機關檔案分類及保存年限區分表。