中科院董事及院長有下列各款情形之一者，當事人得申請迴避︰
一、有前條所定之情形而不自行迴避。
二、有具體事實，足認其執行職務有偏頗之虞。
前項申請，應舉其原因及事實，向董事會為之，並應為適當之釋明；被申請迴避之中科院董事及院長，對於該申請得提出意見書。
不服董事會之駁回決定者，得於五日內提請國防部（以下簡稱本部）覆決，本部除有正當理由外，應於十日內為適當之處置。
被申請迴避之中科院董事及院長在董事會就該申請事件為准許或駁回之決定前，應停止行政程序。但有急迫情形，仍應為必要處置。
中科院董事及院長有前條所定情形不自行迴避，而未經當事人申請迴避者，應由董事會依職權命其迴避。