受補助計畫之督導及查核程序如下：
一、計畫執行期間得由本部或所屬機關進行實地訪查、帳目查核或以其他方式查核計畫執行狀況。
二、受補助單位對於前款查核應予配合，並依實答復工作進度報告或檢備各項經費使用明細。
三、受補助單位有下列情形之一者，本部或所屬機關得依契約核減該計畫當年度或以後年度之管理費，並得要求更換計畫主持人：
（一）執行進度或經費動支落後，且未能改善。
（二）執行項目與契約內容不符。
（三）前款查核結果經評定為未達成預期成果。
（四）違反契約相關約定。
四、依查核結果，本部或所屬機關得進行審查，並得依契約調整該計畫之項目或經費、終止或解除契約。
五、受補助單位拒絕政府審監單位查核，或查核後經要求改善而不予改善者，本部或所屬機關得依契約減少或停止撥付經費、終止或解除契約。
六、受補助單位違反本辦法規定且情節重大者，本部或所屬機關得依契約終止或解除契約。