第一課設課長一人，其掌管事項如左：
一、關於農產品檢驗之執行事項。
二、關於植物檢疫之執行事項。
三、關於農產品檢驗植物檢疫業務委託試驗之執行事項。
四、關於植物檢疫證明書之副署。
五、關於植物病蟲害之試驗研究事項。
六、關於農產品集貨場之設置，勘查及技術員輔導與技術員資格登記審查
事項。
七、關於農產品之包裝檢查、取樣、標識及不合格之改裝處理事項。
八、關於檢驗 (疫) 法規、程序、標準及方法之研究改進與建議事項。
九、關於檢驗 (疫) 物品標本之採製與資料蒐集、整理及建議事項。
十、關於港口驗對之執行事項。
十一、關於農產品檢驗植物檢疫業務計畫及編擬事項。
十二、關於產地辦事處有關業務之督導考核事項。
十三、關於本課屬員工作分配及督導考核事項。
十四、其他交辦事項。