會計室分設二科，各科掌理事項如下：
一、第一科：
(一) 關於歲出、歲入概算、預算之籌劃、審核及編製事項。
(二) 關於動支預備金、經費流用及預算保留之申請及核轉事項。
(三) 關於歲出、歲入分配預算、修改分配預算之審核及編製事項。
(四) 關於各類款項會計憑證之審核事項。
(五) 關於歲出預算之控制及查核事項。
(六) 關於營繕工程、購置、定製及變賣財物之監標及監驗事項。
二、第二科：
(一) 關於決算之編製事項。
(二) 關於各項會計簿籍之登記及會計報告之編送事項。
(三) 關於經費之處理、帳目之核對及公款支付時限之查核事項。
(四) 關於原始憑證之審核、保管及送審事項。
(五) 關於統計表冊格式之擬訂事項。
(六) 關於統計資料之蒐集、整理、分析、供應及統計報告之編纂事項。
(七) 關於會計資訊系統之處理事項。
(八) 關於會計人員任免、遷、調、考績及獎懲之擬辦事項。
(九) 其他有關歲計、會計及統計事項。