本署掌理下列事項：
一、農村發展、水土保持政策與法規之規劃、擬訂、執行及督導。
二、農村土地利用與管理之規劃、協調、輔導及督導。
三、農村再生與農村人力培育之規劃、輔導、協調、審議、評鑑、執行及督導。
四、農村產業發展、農村文化、生態與景觀之調查、規劃、設計、輔導、推動及督導。
五、農村整體環境、農村基礎生產條件、生活機能改善與休閒農業等工程之規劃、設計、輔導、推動及督導。
六、集水區水土保持之調查、規劃、執行及督導。
七、山坡地治山防災工程、水土保持工程與植生綠化工程之調查、規劃、設計、執行及督導。
八、土石流、大規模崩塌與不安定土砂防災之策劃、調查、推動、協調及督導。
九、水土保持管理與水土保持計畫審核監督之策劃、推動、執行、督導及考核。
十、其他有關農村發展及水土保持事項。