共同清除、處理機構得以下列方式設立：
一、醫師公會：由醫師公會集合各醫療機構、醫事檢驗所，共同清除或共同處理其產生之醫療廢棄物。
二、合作社：由醫療機構、醫事檢驗所成立合作社，共同清除或共同處理其產生之醫療廢棄物。
三、財團法人：由醫療機構、醫事檢驗所捐助設立財團法人，共同清除或共同處理其產生之醫療廢棄物。
四、股份有限公司：由醫療機構、醫事檢驗所聯合具有廢棄物清除、處理合作意願者加入投資所設立之股份有限公司，共同清除或共同處理加入投資之醫療機構、醫事檢驗所產生之醫療廢棄物。
前項第三款財團法人之設立，依行政院衛生署監督衛生財團法人準則之規定。
第一項第四款之股份有限公司，具有廢棄物清除、處理合作意願者之總投資比例不得高於百分之二十。本辦法施行前已設立者，其總投資比例依原規定不得高於百分之四十九。