本基金由各電子支付機構於每年五月底前，自前一年度營業收入提撥之，其提撥比率如下：
一、經營電子支付機構之手續費收入：
（一）第一年：提撥新臺幣二百萬元。但僅經營代理收付實質交易款項業務者，提撥新臺幣五十萬元。
（二）第二年至第五年：每年提撥萬分之一。
（三）第六年至第十年：每年提撥萬分之三。
（四）第十一年起：每年提撥萬分之五。
二、依本條例
第二十二條第二項運用支付款項所得之孳息或其他收益總額：按本條例
第二十二條第四項規定之應計提金額，提撥百分之五十。
前項營業收入之範圍，以依本條例
第三十五條經會計師查核簽證之財務報告所載者為準。
兼營電子支付機構業務之銀行及中華郵政股份有限公司，應就前一年度所保管使用者支付款項每日餘額之和除以實際天數，按其前一年度十二月三十一日之活期存款牌告利率計算金額，準用第一項第二款規定核計提撥。
電子支付機構依第一項第一款第一目規定，第一年提撥不足新臺幣二百萬元，或僅經營代理收付實質交易款項業務者，第一年提撥不足新臺幣五十萬元，應於其後年度提撥補足之。