本辦法用詞，定義如下：
一、感染性生物材料：指本法
第四條第四項所定具感染性之病原體或其衍生物，及經確認含有此等病原體或衍生物之物質。
二、設置單位：指持有、保存、使用、處分或輸出入感染性生物材料，並設有實驗室或保存場所之機關、機構、學校、法人或團體。
三、實驗室：指為檢驗或研究目的，使用感染性生物材料進行實驗操作之場所。
四、保存場所：指保存、處分感染性生物材料之場所。
五、生物安全：指為預防工作人員意外暴露，或預防洩漏感染性生物材料，而實施之防護措施。
六、生物保全：指為防止感染性生物材料未經授權而取得、遺失、遭竊、濫用、移轉或洩漏，所實施之保護及管理措施。
七、處分：指感染性生物材料之新增、刪除品項或增減數量之行為。
八、移轉：指提供單位將持有、保存之感染性生物材料，轉予接收單位之行為。
九、病原體：指具感染性，且可造成人類感染之病原微生物及其培養物（液）。
十、生物毒素：指病原體產出，且經純化、分離之有毒物質。
十一、衍生物：指病原體經純化、分離之核酸、質體、蛋白質或其他組成成分，及生物毒素。
十二、陽性檢體：指採自未治癒之感染性疾病病人，或經檢驗確認含有病原體之人類檢體。
十三、事故：指涉及感染性生物材料或發生於實驗室、保存場所之異常事件，致有感染或危害工作人員之虞。