本辦法適用範圍如下：
一、營利事業所得稅：
（一）營利事業依所得稅法
第七十一條、
第七十五條及
第一百零二條之二規定申報之案件，經查核結果，按申報資料核定。但有下列情形之一者，不適用之：
1.申報適用租稅減免規定。
2.申報適用所得稅法
第三十九條規定。
3.當年度結算、決算或清算申報及上年度未分配盈餘申報為併同辦理者，其中任一申報項目未按申報資料核定。
（二）教育、文化、公益、慈善機關或團體依所得稅法
第七十一條規定申報之案件，經查核結果，按申報資料核定。但申報適用同法
第三十九條規定者，不適用之。
二、貨物稅：產製廠商依貨物稅條例
第二十三條第一項規定申報之案件，經查核結果，按申報資料核定者。
三、菸酒稅：產製廠商依菸酒稅法
第十二條第一項規定申報之案件，經查核結果，按申報資料核定者。
四、特種貨物及勞務稅：產製廠商依特種貨物及勞務稅條例
第十六條第二項及營業人依同條第五項規定申報之案件，經查核結果，按申報資料核定者。
五、證券交易稅：代徵人、證券自營商依證券交易稅條例
第三條第一項、第三項規定申報之案件，經查核結果，按申報資料核定者。
六、期貨交易稅：代徵人依期貨交易稅條例
第三條第一項規定申報之案件，經查核結果，按申報資料核定者。
七、娛樂稅：代徵人依娛樂稅法
第九條第一項本文規定申報之案件，經查核結果，按申報資料核定者。
八、印花稅：納稅義務人依印花稅法
第八條第一項後段及第二項規定申報之案件，經查核結果，按申報資料核定者。