第三課設課長一人，其掌管事項如左：
一、關於農產加工品檢驗之執行事項。
二、關於農產加工品各類產品委託試驗之執行事項。
三、關於農產加工品檢 (試) 驗法規、程序、標準及檢驗方法之研究改進
與建議事項。
四、關於農產加工品 (試) 驗資料蒐集、整理、統計分析處理事項。
五、關於農產加工品之包裝檢查、取樣、標識及不合格品之處理事項。
六、關於有關工廠檢驗設備審查及其檢驗、製造、技術輔導事項。
七、關於分等工廠品質管制制度追查、產品抽樣及檢驗紀錄表審核事項。
八、關於罐頭檢驗標紙之審查登記事項。
九、關於港口驗對之執行事項。
十、關於產地辦事處有關業務之督導考核事項。
十一、關於農產加工品業務之計畫、預算之編擬事項。
十二、關於本課屬員工作分配及督導考核事項。
十三、其他交辦事項。