勞工檢查處分設三科，各科掌理事項如左：
一、第一科：
(一) 關於勞工檢查計畫之擬訂、推行事項。
(二) 關於勞動條件檢查之督導、抽查、考核事項。
(三) 關於勞工檢查員之選訓、考核事項。
(四) 關於事業單位自動檢查之規劃、推動事項。
(五) 關於勞工安全衛生服務機構及服務人員之輔導事項。
(六) 關於勞工安全衛生設施及管理之督導事項。
(七) 關於勞工檢查年報之編印事項。
(八) 關於本處綜合業務及不屬其他各科業務事項。
二、第二科：
(一) 關於勞工安全檢查之督導、抽查、考核事項。
(二) 關於職業災害檢查報告之審核事項。
(三) 關於勞工安全檢查作業規定之研訂事項。
(四) 關於事業單位自動檢查安全項目之訂定、推行事項。
(五) 關於危險性機械及設備代行檢查之推行、督導事項。
(六) 關於重大職業災害之檢查事項。
(七) 其他有關勞工安全檢查事項。
三、第三科：
(一) 關於勞工衛生檢查之督導、抽查、考核事項。
(二) 關於勞工職業疾病檢查報告之審核事項。
(三) 關於勞工衛生檢查作業規定之研訂事項。
(四) 關於事業單位自動檢查衛生項目之訂定、推行事項。
(五) 關於事業單位勞工體格檢查、健康檢查之規劃、推動事項。
(六) 關於重大職業疾病之檢查事項。
(七) 其他有關勞工衛生檢查事項。