短卸貨物按左列方式處理：
一、一般進口貨物在查驗時，發現有短卸者，應由驗貨人員在報單上註明
短卸情形，以便轉送至主管艙單單位，核對短卸報告。主管艙單單位
核對後，應在報單上加以註記。如經查明有未經列入船倉兩方短卸報
告者，應依章核辦。
二、貨物短卸情形，並應由主管進口分類估價單位核憑報單在輸入許可證
或開發信用狀申請書上加以註記。
三、貨物放行時，應由簽放關員，核憑報單將短卸情形，在提單上加以註
記。
四、倉庫驗放或船邊、機邊驗放貨物，除於核對艙單時，已接獲短卸報告
，應由主管艙單單位，據短卸報告在報單上註記，並依前二款程序辦
理外，驗貨員如發現有短卸情事，應將實到貨物先予驗放，在報單及
提單上，分別註明短卸情形及放行件數，並將報單及提單退還辦理進
口業務單位，依前列各款程序處理後，將提單文件退還驗貨單位，轉
交聯銷倉庫或船長或管領人存查。
五、免驗貨物，除於核對艙單時已接獲短卸報告，應由主管艙單單位據短
卸報告在艙單上註記，並依第二款第三款程序辦理外，駐庫或駐船或
監視卸貨關員，如發現有短卸情事者，應在提單上註明短卸情形及提
領數量，將提單送辦理進口業務單位，調出原報單，依第一款至第三
款規定之程序處理後，退還稽查組有關單位轉交鎖倉庫或運輸公司或
其代理行存查。大宗貨物於提貨時，始發現有短卸情事者，比照前款
規定辦理。
六、短卸貨物由於實際尚未進口，原則上應不予估價徵稅，惟其價格與整
批貨物無法分開者，得先予一併估稽稅捐，俟短卸貨物補運進口時，
再行查案核明免徵。