學校申請設立科、學程，應擬具設立計畫書，經學校課程發展委員會及校務會議通過後，依下列程序辦理：
一、屬高級中等學校課程綱要已規定之科、學程者：
（一）應於預定辦理學年度前一年三月三十一日前，向各該主管機關申請核准。
（二）各該主管機關應於受理申請後二個月內將審查結果通知學校，直轄市、縣（市）主管機關並應報中央主管機關備查。
二、非屬高級中等學校課程綱要已規定之科、學程者：
（一）應於預定辦理學年度前二年三月三十一日前，向各該主管機關申請核准。
（二）各該主管機關應邀集學者專家、學校代表及高級中等學校課程與師資培育中央主管機關代表審查，直轄市、縣（市）主管機關並應於受理申請後三個月內，將審查結果報中央主管機關核准。
（三）中央主管機關應將審查結果通知學校或直轄市、縣（市）主管機關。
各該主管機關於審查前項各款申請案時，得至學校實地訪視。