申請作業許可案件經主管機關審查通過者，核發南方黑鮪作業許可證明書，許可期限最長為一年。
南方黑鮪作業許可證明書，應以中英文記載下列事項：
一、證書編號。
二、船名、漁船統一編號、總噸位、漁船全長、漁業種類。
三、經營者姓名或名稱。
四、許可之作業洋區、作業組別、作業漁區、作業期間。
五、國際識別編號。
六、IMO船舶識別號碼。
七、附款：經營者所屬漁船於許可捕撈南方黑鮪期間，所取得之遠洋漁業作業許可失效時，南方黑鮪作業許可，同時失效。
經營者應於漁船上放置有效南方黑鮪作業許可證明書影本，以備檢查。