事業或污水下水道系統有下列情形之一者，不適用本章規定：
一、依農業事業廢棄物再利用管理辦法，取得農業主管機關核發畜牧糞尿水施灌農作個案再利用許可。
二、依本辦法取得農業主管機關核准畜牧業沼液、沼渣作為農地肥分使用計畫。
三、畜牧業及畜牧糞尿或生質能資源化處理中心（或沼氣再利用中心）經直轄市、縣（市）主管機關核准輸（運）送符合放流水標準之畜牧廢（污）水，作為植物澆灌。
四、前款以外之事業或污水下水道系統，經直轄市、縣（市）主管機關核准輸（運）送符合放流水標準之廢（污）水，作為花木澆灌。
五、設置不透水材質設施，隔絕廢（污）水與土壤接觸。