重要濕地保育利用計畫之擬訂及核定程序如下；其變更及廢止，亦同。
一、國際級：由中央主管機關擬訂，報行政院核定。
二、國家級：由中央主管機關訂定。必要時，得委由直轄市、縣（市）主管機關擬訂，報中央主管機關定之。
三、地方級：由直轄市、縣（市）主管機關擬訂，報中央主管機關核定。
四、地方級重要濕地範圍跨直轄市、縣（市）轄區者，由各該直轄市、縣（市）主管機關協商擬訂，報中央主管機關核定；必要時，由中央主管機關協調各相關直轄市、縣（市）主管機關共同擬訂或指定由其中一直轄市、縣（市）主管機關擬訂，報中央主管機關核定。