行政院衛生署金門醫院辦事細則（96.06.12訂定） 第3條

本院設下列科、室： 一、內科。 二、外科。 三、婦產科。 四、小兒科。 五、眼科。 六、精神科。 七、牙科。 八、骨科。 九、放射線科。 十、家庭醫學科。 十一、麻醉科。 十二、急診科。 十三、復健科 十四、檢驗科。 十五、護理科。 十六、藥劑科。 十七、行政室。 十八、人事室。 十九、會計室。 二十、政風室。