全中運競賽分高中部及國中部，並各設男生組及女生組。
全中運之組團、組隊單位，規定如下：
一、以每一地方政府為組團單位；各地方政府轄區內每一公立、已立案之私立高級中等學校及國民中學為組隊單位。
二、大陸地區臺商學校及海外臺灣學校，以每一學校為組團單位，或納入地方政府組團單位為一組隊單位。
三、國民中學教育階段非學校型態實驗教育學生，納入設籍學校之組隊單位。
四、高級中等教育階段非學校型態實驗教育學生，取得學籍者，納入設籍學校之組隊單位；未取得學籍者，納入地方政府組團單位為一組隊單位，或由地方政府指定納入學校之組隊單位。