研究發展組掌理事項如左：
一、關於訂定中醫藥研究發展政策規劃事宜。
二、關於中醫基礎理論研究工作事項。
三、關於中醫藥臨床療效之評估、調查、統計、追蹤等研究事項。
四、關於針炙基礎理論研究工作事項。
五、關於針炙臨床療效研究事項。
六、關於中醫人體工程學及醫療儀器研究發展事項。
七、關於中藥材與製劑規格、品管、藥理、藥效、性味歸經等研究事項。
八、關於中藥方劑之研究事項。
九、關於中藥藥用植物引種育苗、栽培改良、擴廣與藥用原植物種原庫建
立等研究事項。
十、關於中藥材之基原鑑定與規格訂定事項。
十一、關於中醫藥使用屬於保育類野生動物部分之藥材基原與替代品研究
事項。
十二、關於國內外中醫藥學術交流之推動事項。
十三、關於中醫藥醫事著作之審核協助事項。
十四、其他有關中醫、中藥、針炙等研究發展事項。