各類隔離設施，應具備功能如下：
一、密閉式溫室：
（一）以透明玻璃或塑膠材質覆蓋，具高度氣密性。對外通氣孔道需具備防止花粉、孢子、種子等微粒外流之空氣過濾裝置。
（二）處理相關排放水、植體廢棄物、栽培介質及器具等之滅菌或焚化設備。
（三）管制人員進門處設置空氣淋洗、緩衝雙門及更衣室等設備。
二、半密閉式溫室：
（一）以透明玻璃或塑膠材質覆蓋屋頂，四周以玻璃或塑膠材質，或所有網洞均應以孔隙小於○．六毫米之細網與外界分隔之設施。
（二）對外通氣孔道或窗戶需有所有網洞均應以孔隙小於○．六毫米之細網與外界分隔。
（三）處理相關排放水、植體廢棄物、栽培介質及器具等之滅菌或焚化設備。
（四）管制人員進門處設置空氣淋洗、緩衝雙門及更衣室等設備。
三、隔離溫室或網室：
（一）對於開花中之試驗植物，具有可防止花粉及種子傳播之隔離袋或器具。
（二）處理相關排放水、植體廢棄物、栽培介質及器具等之滅菌、焚化或掩埋設備。
（三）防止昆蟲及動物進出之設備。
（四）管制人員進出處及進門處有適當消毒設施。
四、隔離田：
（一）田區四周應以鐵絲網圍籬及綠籬植物與外界隔離。
（二）田區應具有處理相關排放水、植體廢棄物、栽培介質及器具等之滅菌、焚化或掩埋設備。
（三）試驗田出入口應有人員及車輛出入管制之設施。
（四）設有材料處理室。
（五）設有清洗作業區，供人員及使用後之農機具清洗用。