國家講座主持人有下列情形之一者，其獎助依其規定辦理：
一、未擔任原任職大學專任教授者，自次一學期起停止獎助。但新任職大學得繼續提供相類似之行政資源、研究環境及開設講座課程者，不在此限。
二、休假研究者，自休假研究之次月起，應報本部停止獎助，並於休假研究期間屆滿後，繼續予以獎助至講座設置期限屆滿為止。
三、依規定辦理借調，且其期限未超過二年者，自借調之次月起，停止獎助，並於借調期限屆滿後，繼續予以獎助至講座設置期限屆滿為止。
四、於獎助期間就任大學校長者，自擔任校長之次月起，應報本部停止獎助，並於校長任期屆滿後，繼續予以獎助至講座設置期限屆滿為止。
前項第四款規定，適用於一百十五年以後獲選之國家講座主持人。