智慧財產及商業法院審判案件，以法官三人合議行之。但有下列情形之一者，以法官一人獨任行之：
一、智慧財產之民事事件第一審程序。
二、犯營業秘密法
第十三條之一、
第十三條之二、
第十三條之三第三項及
第十三條之四之罪適用簡式審判、簡易或協商程序之第一審刑事案件。
三、與前款之案件有裁判上一罪或刑事訴訟法
第七條所定相牽連關係而起訴或合併起訴之簡式審判、簡易或協商程序。
四、前二款適用簡易程序案件之附帶民事訴訟。
合議審判，以庭長充審判長；無庭長或庭長有事故時，以庭員中資深者充之，資同以年長者充之。
獨任審判，即以該法官行審判長之職權。