企劃處分設三科，各科掌理事項如下：
一、綜合規劃及民族自治科：
（一）原住民族政策、制度與法規之綜合擬訂及研議事項。
（二）本會施政方針、施政計畫及業務（工作）報告之彙整編擬事項。
（三）本會委員會議之召開事項。
（四）原住民族事務之綜合規劃及協調事項。
（五）原住民身分與原住民族之認定及族群關係處理事項。
（六）傳統部落組織之輔導事項。
（七）原住民族自治之規劃及推動事項。
（八）原住民族自治行政之輔導、協調及監督事項。
（九）原住民族自治人員之訓練、考核及獎懲事項。
（十）其他有關原住民族事務之研究及企劃事項。
二、管制考核及資訊管理科：
（一）原住民相關資料之調查、蒐集及年鑑出版事項。
（二）本會委託研究、出國報告之管制及出版品管理事項。
（三）重要施政計畫、長官交辦案件之追蹤、管制及考核事項。
（四）本會全面提昇服務品質方案之彙辦、管制與公文之列管、稽催及績
效檢討統計、分析事項。
（五）特種考試原住民行政及技術人員考試之研議事項。
（六）立法委員質詢及監察委員巡迴監察等相關問題之彙復及模擬問答資
料之彙整事項。
（七）本會資訊系統與電腦化業務之規劃、協調、推動、管理、維設及員
工教育訓練事項。
（八）原住民行政資訊系統之規劃、協調、推動及配合國家基礎建設網路
事項。
（九）原住民族地區災害防救之協調、管制及考核事項。
（十）不屬本處其他科及統籌性質之綜合事項。
三、國際事務科：
（一）原住民族國際交流及合作之規劃及推動事項。
（二）原住民族國際事務人才培育之規劃及推動事項。
（三）各國原住民族政策、制度及法規資料之蒐集、分析、研究及編譯事
項。
（四）本會來訪外賓之接待、傳譯及資料建檔事項。
（五）本會外文文件及出版品之翻譯及編印事項。
（六）其他有關原住民族國際事務之規劃及推動事項。