秘書室分設二科，各科掌理事項如下：
一、文書科：
(一) 公文之收發及繕校事項。
(二) 印信之使用及典守事項。
(三) 文書處理及公文改革之規劃研擬事項。
(四) 檔案作業之管理事項。
(五) 本會主管會報、擴大主管會報、擴大業務會報之議事及紀錄事項。
(六) 不屬其他各處、室與本室其他各科及有關統籌性質之綜合業務事項
。
二、事務科：
(一) 工程、財務、勞務之採購事項。
(二) 出納之管理事項。
(三) 財產之管理事項。
(四) 物品之管理事項。
(五) 公務車輛之管理事項。
(六) 辦公處所之管理事項。
(七) 宿舍之管理事項。
(八) 安全之管理事項。
(九) 集會之管理項。
(十) 工友之管理事項。
(十一) 員工福利管理之協辦事項。
(十二) 事務管理工作之檢核事項。
(十三) 本會有關國會聯絡、公共關係及新聞聯繫、發布事項。