甄訓組職掌如下：
一、關於替代役甄訓相關法令之研擬、修正、解釋事項。
二、關於替代役審議委員會之綜合事項。
三、關於替代役提前退役業務之處理等事項。
四、關於各需用機關替代役年度及四年需求調查評估事項。
五、關於替代役意願調查、申請、徵集、輸送、甄選、分發之規劃、督導
事項。
六、關於各種役政及替代役訓練計畫之擬訂、規劃、督導事項。
七、關於替代役役男軍事基礎訓練、專業、在職訓練之推動事項。
八、關於替代役師資培訓、儲備之推展事項。
九、關於替代役訓練經費、教材、表報及成果之規劃、督導事項。
十、其他有關甄訓業務之事項。