管理組職掌如下：
一、關於替代役服勤管理法令之研擬、修正、解釋等事項。
二、關於各種役政及替代役業務之參訪、督考與年度評比及年終檢討會等
事項。
三、關於妨害兵役、替代役申訴、徵兵處理與因案停役等案件之調查及處
理事項。
四、關於維護役政風紀之規劃、督導事項。
五、關於替代役役男服勤管理之規劃、督導事項。
六、關於替代役役男重大事故通報及爭議之處理事項。
七、關於各需用機關服勤管理要點審核事項。
八、關於替代役役男請假、獎懲法規增修事項。
九、關於替代役役男服役期間輔導教育及獎懲辦理事項。
十、關於替代役役男生活管理之督導事項。
十一、其他有關管理業務事項。