權益組職掌如下：
一、關於常備役及替代役服役役男權益法令之研擬、修正、解釋等事項。
二、關於常備役及替代役役男留守、復職、慰勞業務之規劃、督導事項。
三、關於常備役及替代役役男優待及扶 (慰) 助業務之規劃、督導事項。
四、關於替代役役男醫療、就診規劃、督導事項。
五、關於替代役役男一般保險、全民健康保險、團體意外保險之研擬、規
劃、督導事項。
六、關於替代役撫卹案件之規劃、督導事項。
七、關於常備役及替代役役男傷殘慰助金、安養津貼之規劃、督導事項。
八、關於傷殘鑑定之指定醫院協調、爭議處理事項。
九、關於替代役安全濟助基金之規劃、督導事項。
十、死亡軍人及替代役役男因公死亡者之安葬、紀念、祭祀之規劃、督導
事項。
十一、關於地方軍人公墓 (忠靈祠) 之規劃、督導事項。
十二、關於替代役役男、薪俸、地域加給、主副食費與年終工作獎金之發
放及相關法規之研擬、修正、解釋等事項。
十三、關於替代役需用機關役男經理物品之策劃、採購、補給、保管、維
護等事項。
十四、關於配合支援相關替代役非常事變之後勤事項。
十五、其他有關權益事項。