秘書室分設三科，掌理事項如下：
一、第一科
(一) 關於檔案法規制 (訂) 定、修正、廢止之研議或審議事項。
(二) 關於檔案法規疑義之協調解釋事項。
(三) 關於本局內部規章異動之通報事項。
(四) 關於檔案相關法規資料之蒐集、整理及研究事項。
(五) 其他有關本局法制作業事項。
二、第二科
(一) 關於營繕工程、財物及勞務之採購事項。
(二) 關於公務車輛之管理事項。
(三) 關於駕駛、技工及工友之管理事項。
(四) 關於財產與物品之管理及維護事項。
(五) 關於設備之使用管理及安全維護事項。
(六) 關於經費之出納事項。
三、第三科：
(一) 關於主管會報、業務會報之議事事項。
(二) 關於國會聯絡、公共關係及新聞聯繫事項。
(三) 關於公文之收發、分辦、繕校及統計事項。
(四) 關於公文之流程管理及稽核事項。
(五) 關於印信之使用及典守事項。
(六) 關於本局檔案之管理及應用事項。
(七) 其他不屬各組、室業務之綜合事項。