檔案徵集組分設四科，掌理事項如下：
一、第一科
（一）關於機關檔案點收與機密檔案管理制度之規劃、推動及諮詢事項。
（二）關於機關檔案分類系統與編目規範之研訂及推動事項。
（三）關於機關檔案立案編目作業之輔導事項。
（四）關於本組綜合業務及不屬其他各科業務事項。
二、第二科
（一）關於機關檔案銷毀目錄審核制度之規劃及推動事項。
（二）關於機關檔案銷毀計畫及銷毀目錄之審核事項。
（三）關於機關檔案因特殊狀況毀損之審核及備查事項。
（四）關於機關檔案銷毀作業之諮詢事項。
三、第三科
（一）關於機關檔案保存年限審核制度之規劃及推動事項。
（二）關於機關檔案保存年限之審核事項。
（三）關於檔案鑑定制度之規劃及輔導事項。
（四）關於機關檔案鑑定報告之審核事項。
（五）關於機關檔案保存年限及檔案鑑定作業之諮詢事項。
四、第四科
（一）關於國家檔案移轉制度之規劃、推動、協調及輔導事項。
（二）關於國家檔案鑑選與移轉目錄之審核及輔導事項。
（三）關於私人或團體所有珍貴文書之受贈、受託保管及收購事項。
（四）關於國家檔案移轉作業諮詢事項。