本辦法中華民國一百十三年四月十九日修正生效前，已進行調查、輔導之事件，應依原規定處理至完成調查、輔導，並製作調查報告、輔導報告後，依本辦法修正後規定繼續處理；其他事件，應自本辦法一百十三年四月十九日修正生效之日起，依本辦法修正後規定處理。
本辦法中華民國一百十三年四月十九日修正生效前，已進行申復之事件，尚未終結者，應依修正前規定繼續處理至申復程序終結。
本辦法中華民國一百十五年一月十四日修正生效前，已進行調查之事件，涉及修正前
第十三條第一項第一款所定由學校直接派員調查者，應依原規定處理至調查完成，並製作簡要之調查報告後，依修正生效後之規定繼續處理；其他事件，應自本辦法一百十五年一月十四日修正生效之日起，依本辦法修正後規定處理。
本辦法中華民國一百十五年一月十四日修正生效前，已進行調查之事件，涉及本法
第十四條第一項第八款情形者，及學校已報備查之事件，涉及修正前
第五十二條第四款所定審議委員會審議者，均應依修正前之規定繼續處理。