鮪延繩釣漁船未經許可，不得捕撈南方黑鮪；捕獲該魚種時，應即丟棄，並將丟棄量填報於漁撈日誌及電子漁獲回報系統。
配額限制魚種之單船許可配額用罄後，鮪延繩釣漁船再捕獲該魚種時，應即丟棄，並將丟棄量填報於漁撈日誌及電子漁獲回報系統。
鮪延繩釣漁船不得捕撈或持有下列魚種；捕獲時，活體應釋放，屍體應丟棄，並應於漁撈日誌及電子漁獲回報系統填報釋放或丟棄之個體數目：
一、鯊魚，其尾叉長未滿一百公分。
二、紅肉旗魚、黑皮旗魚、白皮旗魚或雨傘旗魚，其下顎至尾叉長未滿六十公分。
三、短鰭馬加鯊、長鰭馬加鯊。但經觀察員隨船進行觀察任務並確認該魚種於捕獲時已死亡者，得留艙。