新工組分設四科，各科掌理事項如下：
一、施工科
（一）工程施工考核及督導、變更設計及工期展延相關作業（文件）審核
等事項。
（二）單項工程當年度計畫之審核、年度工程經費之審核、工程經費執行
控管等事項。
（三）查核金額以上開工報告、竣工驗收、工程決算、竣工報告之審核等
事項。
（四）上級及審計單位有關施工進度核復之處理等事項。
（五）其他交辦事項。
二、工事科
（一）公路新闢及改善工程預算之編製與審核、工程發包作業等事項。
（二）建築工程預算之編製與審核、工程發包作業、竣工驗收及結算等事
項。
（三）工程契約之訂定與修正，政府採購事項相關法規之擬訂及解釋等事
項。
（四）所屬工程單位有關政府採購法規及相關規定之教育訓練事項。
（五）其他交辦事項。
三、設計科
（一）查核金額以上之工程勘查及設計審核事項。
（二）查核金額以上委託服務費之委託設計案核定事項。
（三）委託設計服務工作投標須知擬訂及修訂事項。
（四）委託設計服務評選辦法擬訂及修訂事項。
（五）工程委託設計契約範本擬訂及修訂事項。
（六）工程設計規範、規格之研訂、工程標準圖之修訂等事項。
（七）都市計畫變更案件事項。
（八）新材料及新工法之採用事項。
（九）其他交辦事項。
四、勞工安全科
（一）勞工安全衛生作業標準之研訂、計畫審核、經費執行與控管等事項
。
（二）「交通、安衛、環保施工說明書」及「工地交通、安衛、環保稽查
作業暨獎懲要點」之修訂等事項。
（三）勞工安全衛生與工地環保督導及環評追蹤考核事項。
（四）各種勞工安全衛生教育訓練、研習、觀摩作業之執行事項。
（五）其他交辦事項。