本局設左列各科、室、隊、台，分別掌理有關事項：
一、預防科：犯罪預防、企劃、宣導等事項。
二、偵查科：犯罪偵查情報、設計、管考及肅毒等事項。
三、司法科：司法警察及違警處理等事項。
四、紀錄科：犯罪資料統計等事項。
五、鑑識科：刑案證物鑑析等事項。
六、國際刑警科：國際刑警等事項。
七、指紋室：指紋分析鑑識等事項。
八、法醫室：刑案屍體之解剖及鑑驗等事項。
九、督導室：刑案督導、連絡、通訊等事項。
十、刑事科學研究室：刑事科學鑑識之研究發展等事項。
十一、總務室：財物、事物等事項。
十二、保防室：機關保防等事項。
十三、偵查第一隊：重大刑案之偵查及支援等事項。
十四、偵查第二隊：重大刑案之偵查及支援等事項。
十五、特殊事件處理隊：爆炸物及疑似爆炸物之排除處理等事項。
十六、國際刑警無線電台：國際刑警無線電通訊事項。
十七、警衛隊：門禁安全維護等事項。
各科、室、隊、台得依業務需要分組辦事，特殊事件處理隊並得於直轄市
、縣 (市) 重要地區設組辦事。