糧食儲運組分設三科，各科掌理下列事項：
一、糧食收購科：
（一）稻米保價收購方式、價格及數量之訂定。
（二）公糧稻榖收購制度之檢討、研訂及推動。
（三）獎勵契作飼料玉米業務之策劃及督導。
（四）契作飼料玉米銷售作業之策劃與輔導。
（五）查核申報種稻面積之策劃及督導。
（六）高梁、飼料玉米保價收購與銷售計畫之研擬及推動。
（七）收購與處理天然災害稻穀之策劃及督導。
（八）農戶耕地資料建檔之策劃及督導。
（九）水旱田輪作、休耕資料建檔之策劃及督導。
（十）補助農民繳售公糧稻穀隨糧包袋費用之擬訂及督導。
（十一）糧食動員計畫之策劃、推動及執行。
二、倉儲管理科：
（一）糧食倉儲制度之策劃及推動。
（二）公糧委託業務之策劃及管理。
（三）公糧委託業務各項費用及費率之訂定。
（四）公糧委託業務違約案件處理之督導。
（五）公糧收儲計畫之規劃及倉容籌措之督導。
（六）公糧庫存量查核及督導。
（七）公糧倉儲蟲鼠鳥害防治計畫之擬訂及督導。
（八）倉儲公糧物資災害處理之督導及損耗率之訂定。
（九）公糧倉庫興建與修繕計畫及倉儲設備補助計畫之擬訂及管理。
（十）穀物倉儲自動化與乾燥中心設置之策劃及輔導。
（十一）輔導農會申請變更非都市土地興建糧食倉庫及相關設施。
三、糧食供銷科：
（一）公糧收撥計畫之策劃及推動。
（二）公糧供銷業務之策劃、處理及督導。
（三）公糧加工、副產品處理之策劃與管理及碾率之訂定。
（四）進口公糧之採購。
（五）國內外糧食救助業務之策劃及推動。
（六）公糧運輸業務之策劃及推動。
（七）公糧包裝資材供需計畫之策劃及推動。
（八）緊急時期糧食供應之策劃及管理。
（九）糧食產業國際經貿策略之擬訂及執行。
（十）民間進口稻米配額分配。
（十一）國內稻米安全存量之管控。