申請人於漁獲證明書核發後，應依下列規定辦理核銷或註銷：
一、使用漁獲證明書者：其應向主管機關辦理核銷之漁獲證明書種類、期間及應檢附文件如附件三。
二、因故未使用漁獲證明書者：應於證明書有效期間內，檢附下列文件，主動向主管機關辦理註銷：
（一）註銷原因之說明。
（二）漁獲證明書正本。
（三）漁獲物或漁產品輸出後始發生註銷原因者，應另檢附其出口運輸單據影本，及輸出地海關核發之出口報單證明聯或其他相關證明文件。
申請人未於前項第一款所定期間辦理核銷，得於期間屆滿前敘明理由，並檢附原核發之漁獲證明書正本及相關證明文件，向主管機關申請展延期間，每次展延最長期間依附件三所定期間辦理，且不得逾
第六條第三項規定之有效期間。
未能依前二項規定完成核銷者，主管機關得通知申請人限期補核銷。