負責指導之主任檢察官、實任或試署檢察官（以下簡稱指導檢察官）指導方式如下：
一、指導檢察官於指導期間，得視實際情形，親赴偵查庭或至勘驗、搜索或其他偵查現場或審判之法庭實施現場指導，或以電話、傳真或其他便捷方式指導該候補檢察官辦案。
二、指導檢察官於指導期間得隨時要求候補檢察官報告案件之辦理過程，並予適切之指導；受指導之候補檢察官於前開辦理偵查、執行或公訴案件期間，除內、外勤時間外，其強制處分之實施、聲請及令狀之核發，均應經指導檢察官核閱。
三、受指導之候補檢察官所撰寫之辦案書類（如起訴書、不起訴處分書、緩起訴處分書、上訴書、補充理由書或論告書等）應由指導檢察官詳加審閱，並與該候補檢察官共同署名，該案之辦案成績歸候補檢察官。但受指導之候補檢察官就案件之進行或結案方式，與指導檢察官見解不同致無法形成共識者，應依指導檢察官之見解結案，該案經判決無罪確定或再議之聲請有理由者，不列入該候補檢察官辦案成績。
四、指導檢察官於指導候補檢察官期間，得折計辦案件數，其折計方法由各地方檢察署酌情定之。