本基金之用途如下：
一、民航事業作業基金：
（一）場站及助航設施建設、改良支出。
（二）航空器及其裝備購置支出。
（三）航空客貨運園區開發支出。
（四）場站作業維持支出。
（五）助航及安全作業支出。
（六）民航事業之宣導、推廣、訓練及研究發展支出。
（七）航空噪音補償金及回饋金支出。
（八）離島地區居民航空票價補助支出。
（九）對與民航發展有關機構或團體之捐助支出。
（十）航空公司經營離島航線之獎助支出。
（十一）參與相關航空事業之投資支出。
（十二）管理及總務支出。
（十三）其他有關支出。
二、國道公路建設管理基金：
（一）具自償性國道公路之建設及其設施之擴充、改良支出。
（二）辦理區段徵收取得可建土地等開發成本支出。
（三）國道公路維護管理支出。
（四）本基金融資之利息及手續費支出。
（五）國道公路業務之宣導、推廣、訓練及研究發展支出。
（六）管理及總務支出。
（七）其他有關支出。
三、鐵道發展基金：
（一）鐵道產業規劃及國際交流相關支出。
（二）整體鐵道路網之相關規劃作業支出。
（三）鐵道營運監理相關支出。
（四）辦理區段徵收取得可建土地等開發成本支出。
（五）土地開發經營管理相關支出。
（六）高速鐵路沿線之租金及相關支出。
（七）投資計畫之事業投資所需資金及相關支出。
（八）其他高速鐵路財改方案平穩機制之相關支出。
（九）管理及總務支出。
（十）本基金融資之利息及手續費支出。
（十一）其他有利鐵道發展支出。
四、觀光發展基金：
（一）國家風景特定區之興建、整建、規劃、維護及維持等觀光設施支出。
（二）國際及國內觀光配套設計、宣導、推廣、行銷、研究發展等支出。
（三）補助地方政府及觀光遊憩相關單位興建、整建、規劃、維護、維持等觀光設施支出。
（四）辦理經行政院核定之國家風景特定區內土地開發計畫，區段徵收取得可建土地等開發成本支出。
（五）管理及總務支出。
（六）其他有關支出。
五、臺鐵局撥入資產及債務管理基金：
（一）政府撥入臺鐵局經管資產之開發經營管理相關支出。
（二）為償還臺鐵局短期債務所舉借債務之利息及手續費支出。
（三）管理及總務支出。
（四）其他有關支出。