行政課職掌如下：
一、警力配置之調整，派出所、查驗登記站之設置、轄區劃分或變更及勤
務實施之規劃等事項。
二、交通安全維護、管制、整理、宣導及交通事故、交通違規案件之處理
事項。
三、警備、警衛、警戒之規劃督導及機動保安警力申請調派事項。
四、民防業務及配合防救災害之規劃、督導及警力派遣事項。
五、協助執行港務行政之規劃、督導事項。
六、安檢業務之規劃、執行與督導事項。
七、港口初期應變之處理與年度演習（訓）之規劃、執行與督導事項。
八、港安偵測規劃、執行與督導事項。
九、港區通行證製作、核發、註銷及資料管理事項。
十、其他有關行政、交通、保安、民防、戶口等業務事項。