活魚運搬船漁業人或漁業從業人有下列情形之一者，依本法
第六十五條第八款規定處新臺幣三萬元以上十五萬元以下罰鍰；情節重大者，廢止其作業許可：
一、違反
第十條規定，未於每航次出港前申請許可即出港作業，或未接受海岸巡防機關檢查。
二、違反
第十一條、
第十二條或
第十五條規定，裝卸清單或共同合作運搬養殖活魚紀錄表填報內容或上傳文件不實。
三、違反
第十三條第一項規定，未與養殖漁民或中轉場負責人將養殖活魚共同封緘各自留樣，或未自活魚運搬船出港日起凍存三個月。
四、違反
第十三條或
第十四條第二項規定，規避、妨礙或拒絕檢驗或調查。
五、違反
第十六條第一項或第二項規定，未於每航次出港前通報及確認船位回報正常，或出港後未維持船位回報器於開啟狀態，或出港後未每小時自動回報船位，或返港後未通報即擅自關閉船位回報器。
六、違反
第十六條第四項規定，未依限期返港，或未依規定通報船位，或船位通報不實，或未完成修復船位回報器即擅自出港。
七、違反
第十七條第二款規定，運搬非活體型態之魚貨或
第二條第一款所定養殖活魚以外之水產動植物。
八、違反
第十七條第八款規定，收取費用經營運送業務。