徵收對象之排放水量，依下列方式之一計算：
一、依水污染防治許可證（文件）登記之每日核准量之百分之九十計算。
二、以申報繳費當期之定檢申報總水量計算。
三、依規定設置水量自動監測設施者，得以申報期間傳輸之自動監測數據累加計算其排放水量。
四、依規定無須定檢申報者：
（一）依累計型流量計測設施量測之排放水量計算。
（二）畜牧業依當期實際在養頭數產生之廢水量計算，養豬業每頭豬隻以每日廢水產生量二十公升計算。
（三）經直轄市、縣（市）主管機關核准之計測設施或計量方式計算。
五、其他經中央主管機關認可之計算方式。
徵收對象依前項第二款至第四款規定計算之水量，其數值低於主管機關之查核量時，以主管機關之查核量計算。
徵收對象有
第十條第六款情形者，該期排放水量依申報繳費當期前一年全國該業別水污染防治許可證（文件）登記之前百分之五十之每日核准排放量平均值計算。但該每日核准排放量平均值低於主管機關之查核量時，以主管機關之查核量計算。
前項徵收對象得以實際量測水量或各項用水來源之憑證、水量平衡圖、水污染防治許可證（文件）申請資料、事業規模、其他足以佐證水量等估算資料先行申報排放水量，並於接獲主管機關通知後，應於期限內將相關資料提報主管機關審查。未提報者，逕依前項規定方式計算。
累計型流量計測設施校正期間或有其他經主管機關認可之因素，無法計測之水量，以申報當期流量計測設施設置之日平均水量計算。
徵收對象應依實際運作情形申報排放水量，以水污染防治許可證（文件）登記之每日核准量計算者，得以申報繳費當期實際運作日數先行計算及申報排放水量，並於接獲主管機關通知後，應於期限內將相關資料提報主管機關審查。未提報者，逕依水污染防治許可證（文件）登載之排放日數計算。