執行單位辦理其研發成果授權時，應以非專屬授權方式為之。但有下列情形之一，並事先報資助機關同意者，得以專屬授權方式為之，並於專屬授權後，報資助機關備查：
一、研發成果尚未達量產階段，需被授權人投入鉅額資金或提供重要發明專利，繼續開發或製成商品銷售。
二、研發成果產品上市前，需經長期實驗，且需依法律規定取得許可。
三、有利於整體產業發展及公共利益。
四、科技計畫屬產學合作計畫者，其產業合作對象出資達計畫總經費百分之三十以上，且契約約定，該合作對象得優先取得五年以內之專屬授權。
執行單位對於其研發成果之授權實施地域、時間、內容及方式，必要時，得予以限制。
第一項第四款得優先取得專屬授權之產業合作對象，應於產學合作計畫執行結束後半年內，向執行單位申請專屬授權；屆期未申請者，執行單位應以書面通知其限期說明；屆期未說明者，執行單位得逕行授權其他對象實施。